从ASCII到NetCDF的转换

Question

我是netCDF库的新用户，所以我为这个基本问题道了歉。 我试图将具有4列（lon，lat，depth，velocity）的ascii文件转换为netCDF。我收到以下错误：

VP [：] =文件[：，：，：，：] IndexError：数组太多指数

能否请你帮我找的原因错误？我已将变量的维数设置为行数。是对的吗？

在此先感谢。

该文件是大，你可以在这里找到一个样本：https://www.dropbox.com/s/qq9529vcvq8t1av/test.txt?dl=0

# -*- coding: utf-8 -*- 
from netCDF4 import Dataset 
import numpy as np 
import sys 


file = np.loadtxt('test.txt', delimiter=' ') 
# NC file setup 
mydata = Dataset('Vp.nc', 'w', format='NETCDF4') 
mydata.description = '3D VP velocity model' 

# dimensions 
mydata.createDimension('latitude', 1000) 
mydata.createDimension('longitude', 1000) 
mydata.createDimension('depth', 1000) 

Vp = mydata.createVariable('Vp', 'f4', ('latitude', 'longitude', 'depth'), fill_value=0) 

Vp[:] = file[:,:,:] 
Vp.units = 'km/s' 

Answer 1

这里有几个问题

• 不要使用内置函数的名称作为变量名，像file
• 不要将坐标数据放入变量中，而是放入单独的变量中
• 如果将数据添加到NetCDF变量中，切片大小为mus T为等于
• 当前的误差距离要求错尺寸从numpy的阵列，它是在你的例子1000,4文件

这里是工作的例子，但我没有，因为提取正确的变量数据我不知道实际的结构，还要小心重塑。

from netCDF4 import Dataset 
import numpy as np 
import sys 


input_file = np.loadtxt('test.txt', delimiter=' ') 
# NC file setup 
mydata = Dataset('Vp.nc', 'w', format='NETCDF4') 
mydata.description = '3D VP velocity model' 

# dimensions 
mydata.createDimension('longitude', 128) 
mydata.createDimension('latitude', 4) 
lat = mydata.createVariable('latitude', 'f4','longitude') 
lat.long_name = "latitude" 
lat.units = "degrees_north" 
lat.standard_name = "latitude" 
lon = mydata.createVariable('longitude', 'f4','latitude') 
lon.long_name = "longitude" 
lon.units = "degrees_east" 
lon.standard_name = "longitude" 

## mydata.createVariable('depth', 1) 

Vp = mydata.createVariable('Vp', 'f4', ('longitude','latitude'), fill_value=0) 

Vp[:128,:4] = input_file[:512,3].reshape(128,4) 
## lon[:] = ??? 
## lat[:] = ??? 
Vp.units = 'km/s'