ete3

0热度

2回答

有没有什么办法可以让二叉搜索树有简单的ascii可视化？

我开发了一个二叉搜索树结构，我想添加一些可以可视化树的功能。 下面的代码属于二叉搜索树： class Node(object): def __init__(self, data): self.data = data self.leftChild = None self.rightChild = None def insert(self, d

algorithm python-3.x binary-search-tree ete3 2016-09-21

---

2热度

1回答

ete3：如何从分类标识中获得分类级别名称？

我想用它来转换一堆标识符，但我需要确切地知道哪个分类等级被分配给每个分类标准代码。下面显示的是一个有意义的转换示例，但我不知道如何标记某些分类调用。基本的分类等级是:(域，王国，门，类，次序，家庭，属和物种）https://en.wikipedia.org/wiki/Taxonomic_rank。 对于大多数情况下，它很容易，但在细菌的亚种和菌株的情况下，这可能会引起混淆。 如何获得ete3来指定

python bioinformatics taxonomy ncbi ete3 2017-09-10

---

0热度

2回答

Python ete3 - 有没有方法可以拉伸系统发生树的分支？

我正在尝试阅读系统发育树，并将它的分支伸展得比原来的更大或更小，但我没有找到如何。 伸展需要在树上 - 而不是它的可视化。 例如，下面的代码读取一棵树，并提出它： from ete3 import Tree t = Tree("(2azaa:0.1871453443,1dz0a:0.1944528747, (((1joi:0.1917345578,1nwpa:0.206793251):0.20

python phylogeny ete3 r-ape 2017-04-15

---