ete3：如何从分类标识中获得分类级别名称？

Question

我想用它来转换一堆标识符，但我需要确切地知道哪个分类等级被分配给每个分类标准代码。下面显示的是一个有意义的转换示例，但我不知道如何标记某些分类调用。基本的分类等级是:(域，王国，门，类，次序，家庭，属和物种）https://en.wikipedia.org/wiki/Taxonomic_rank。

对于大多数情况下，它很容易，但在细菌的亚种和菌株的情况下，这可能会引起混淆。

如何获得ete3来指定谱系ID在分类级别中对应的排名？

import ete3 
import pandas as pd 

ncbi = ete3.NCBITaxa() 
taxon_id = 505 
lineage = ncbi.get_lineage(taxon_id) 
Se_lineage = pd.Series(ncbi.get_taxid_translator(lineage), name=taxon_id) 
Se_lineage[lineage] 


1      root 
131567 cellular organisms 
2     Bacteria 
1224   Proteobacteria 
28216  Betaproteobacteria 
206351   Neisseriales 
481   Neisseriaceae 
32257    Kingella 
505   Kingella oralis 
Name: 505, dtype: object 

Answer 1

使用ncbi.get_rank()得到的{id:name}字典然后做一些基本的转换来获得{name:taxonomy}