tidyverse

1热度

3回答

我有一个数据框包含约450K甲基化的beta值。 450个探针用于两个样品。该数据显示在三列，看起来像这样： >head(ICGC) submitted_sample_id probe_id methylation_value 1 X932-01-4D cg00000029 0.6 2 X932-01-6D cg00000029 0.4 3 X932-01-4D cg0

-2热度

1回答

是否存在与SELECT ... COUNT（*）... GROUP BY ...等价的等价物？

我想了解如何完成“group by”和“count”功能。我看了好几篇文章，没有找到我想要的东西;如果有已经发布的答案，我会很感激链接。例如，我正在查找数据中的异常值;我想知道哪些地方收到的最“坏”的措施： place = rep(c('AL','AK','AZ','AR','CA','CO','CT','DE','FL','GA','HI'), times=4) measure = rep(

2热度

4回答

编程分解数据框中的选定列，整洁的方式？

下面是一个简单的例子： library(tidyverse) frame <- tribble( ~a, ~b, ~c, 1, 1, 2, 5, 4, 7, 2, 3, 4, 3, 1, 6 ) key <- tribble( ~col, ~name, ~type, ~labels, 1, "a", "f", c("on

1热度

1回答

传播价值从儿童与整洁

我有一棵树在属级别注释（即每个叶子都有一个名字），我想宣传叶子的颜色在分支/边缘，只要孩子有相同的属，像这样的情节： Source 我的树是here（对不起，dput不工作...），他看起来就像是： library(ggraph) library(tidygraph) load("tree_v3") TBL %>% activate(nodes) %>% as_tibble # A ti

2热度

2回答

one_of（）为什么调用它？

为什么dplyr::one_of()被称为？所有其他select_helpers名称对我而言是有意义的，所以我想知道是否有我不明白的one_of()方面。我对one_of()的理解是，它只允许您使用名称的字符向量来选择变量，而不是将它们的名称放入select()调用中，但是您可以获得所有名称位于向量中的变量，而不仅仅是其中之一他们。那是错的，如果这是正确的，名字one_of()从哪里来？

2热度

1回答

使用带有否定选择佣工如mutate_at（）（未one_of（））

我有一个看起来像这样的数据： library(dplyr) set.seed(123) df <- data_frame(X1 = rep(LETTERS[1:4], 6), X2 = rep(1:2, 12), ref = sample(1:50, 24), sampl1 = sample(1:50, 24), var2 =

1热度

1回答

在嵌套数据帧列上使用mutate_at（）生成多个未发生列

我正在使用dplyr,tidyr和purrr进行实验。我的数据是这样的： library(tidyverse) set.seed(123) df <- data_frame(X1 = rep(LETTERS[1:4], 6), X2 = sort(rep(1:6, 4)), ref = sample(1:50, 24), sampl1 = sa

4热度

3回答

在pkgdown参考中包含“所有其他函数”yaml

我有一个pkgdown站点，其中我将许多函数分组到参考文件.yml的类别中。我想知道是否有办法将我没有明确分类的所有功能放入他们自己的类别中。我唯一的想法是使用matches功能，像这样： reference: - title: "someCategory" contents: - myFunction - title: "other" contents:

1热度

2回答

联合所有tibble列与tidyr

我想统一所有的列在一个tibble到一个为以后处理。每当我尝试这样做，我得到错误错误if（！after）c（values，x）else if（after> = lengx）c（x，values）else c（x [1L ：后]：缺少其中TRUE/FALSE所需值的tidyr:unite documentation说，你可以不指定任何列做到这一点这里的玩具，例如： ex <- as_tibble

1热度

1回答

如何使用dplyr突变两个数据帧的条件

我有两个数据帧，它们基于第三个更大的数据集。我想根据第二个数据框中的条目来标准化一个数据帧中的数据 - 我最喜欢使用dplyr，但其他包/解决方案也非常感谢:) 在我的第一个数据框中，我有不同器官的数量。数据帧organ_count # A tibble: 5 x 2 organs count <fctr> <int> 1 Organ_A 23