如何使用Rserve在R中读取R中的.csv文件以在LAMP系统上与PHP进行通信？

我想将.csv文件读入R.我已经能够将文件的绝对路径发送给R，它将通过下面的PHP代码中的$test变量返回它。 $r->evalString("data<-read.csv(filetim,header=TRUE)");返回下面列出的错误。任何想法是什么导致了错误？如何使用Rserve在R中读取R中的.csv文件以在LAMP系统上与PHP进行通信？

<?php 
require_once 'rconfig.php'; 
require 'rConnection.php'; 
try { 
    # Connect to R via Rserve 
    echo '<p>Connecting to Rserve '.RSERVE_HOST; 
    $r = new Rserve_Connection(RSERVE_HOST); 
    echo ' Connection OK</p>'; 
    # Associate filename with the file's absolute path 
    $r->evalString("filetim=('folder/folder/folder/file.csv')"); 
    $r->evalString("filebob=('folder/folder/folder/file2.csv')"); 
    # Check if the filename is being stored 
    $test = $r->evalString("filebob"); 
    echo $test; 
    # Read the .csv file into variable "data" 
    $r->evalString("data<-read.csv(filetim,header=TRUE)"); 
    $r->close(); 
} catch(Exception $e) { 
    echo $e; 
} 
?>

错误：

'Rserve_Exception' with message 'unable to evaluate' in /folder/folder/folder/folder/folder/rConnection.php:239 Stack trace: #0 /folder/folder/folder/folder/folder/rcodetest.php(17): Rserve_Connection->evalString('data<-read.csv(f...') #1 {main}

来源

2013-12-20 user2932733

此解决方案假定你是一个Linux系统上。对于Windows（如果你让Rserve工作......）故事是一样的。

您给read.csv的路径不是绝对的，而是相对路径。 [R从工作目录开始（默认情况下在Linux系统中经常用户的主目录，通过~中的R表示）

在你的情况下，绝对路径将是

$r->evalString("filetim=('/folder/folder/folder/file.csv')");

要找出考虑R工作目录，你可以使用getwd()。使用try()，你可以赶上内半径误差消息得到什么地方出了错一个更好的主意，因为Rserve的页面在这里解释说：http://rforge.net/Rserve/faq.html#errors

您也可以使用R A tryCatch()得到半径误差消息或警告信息。在read.csv()特定情况下的警告信息可能比错误更有效（这只是说“无法打开连接”）

如：

$err = $r->evalString("tryCatch(read.csv(filetim,header=TRUE), error = function(e) e)"); 
echo $err;

捕获错误，或

$err = $r->evalString("tryCatch(read.csv(filetim,header=TRUE), warning = function(w) w)"); 
echo $err;

赶上警告。这应该让你知道R在哪里查找你的文件。请注意，您可能必须将整个呼叫包装到as.character()的TryCatch中。我不确定Rserve与php结合是否可以处理简单的警告对象。

来源

2013-12-20 16:09:07

如何使用Rserve在R中读取R中的.csv文件以在LAMP系统上与PHP进行通信？

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