ImageJ - 即使遇到错误，如何继续批处理

Question

我在ImageJ中编写了一个宏，在BMP图像文件列表上运行批量“测量”。我使用headless.jar以无头模式在远程Linux机器上运行代码。

每当ImageJ在列表中读取/加载图像时遇到错误或异常，它都会退出该过程。因此，我必须不断监视进程并手动强制ImageJ跳过文件。

有没有一种方法可以强制ImageJ继续执行该过程，即使遇到了错误/异常？并可能在日志或其他文件中报告文件名？

Answer 1

不可能在ImageJ宏语言中显式处理异常。但是，在进行有问题的宏调用之前，可以通过检查前提条件等来防范某些类型的异常。

例如，如果您的文件列表中包含不存在的文件，则可以使用File.exists(path)[1]确保文件存在，然后再尝试将其打开。

当然，并不是所有的错误条件都可以通过这种方式很容易地检查（例如格式不正确的BMP），所以我同意medPhys-pl将您的宏重写为Imagej插件是最完整的解决方案。使用宏记录器（Plugins > Macros > Record）设置为以插件模式记录而非宏记录可以很好地开始。一旦你有相关的命令来执行，您可以通过使用Fiji的Script Editor它们打包成一个插件很容易：

1. File > New > Script
2. Language > Java
3. Templates > Java > Bare PlugIn
4. 你的命令粘贴到run方法。

有关编写ImageJ插件的更多详细信息，请参阅斐济wiki的Introduction into Developing Plugins。