在PBS作业脚本中获取壁挂时间

Question

将作业脚本提交给PBS排队系统时，自动或由用户指定壁挂时间，例如，通过

#PBS -l walltime=1:00:00 

问题是如果这个时间可以从作业脚本访问。有没有一个环境变量或其他方式来获得这个walltime。

最后，作业脚本应该不时决定是否有足够的时间做更多的工作，以便作业不会被排队系统消灭。

更新：

至少如果用户指定的walltime在资源列表，我可以提出以下解决方法（工作对于bash）

read _ _ PBS_WALLTIME <<< `qstat -f $PBS_JOBID | grep "Resource_List.walltime"` 

从解析walltime qstat输出并将值放入PBS_WALLTIME变量中。因此，命令

echo $PBS_WALLTIME 

将产生类似

1:00:00 

Answer 1

这是存储在环境变量$ PBS_WALLTIME。

当然，这是TORQUE，我不确定你正在使用哪个PBS排队系统。

Answer 2

我一直在寻找答案，上面的评论给了我一个想法，似乎工作得很好。您可以使用了qstat和使用sed抓住从它的相关信息：

qstat -f $PBS_JOBID | sed -rn 's/.*Resource_List.walltime = (.*)/\1/p' 

把这个在你的PBS脚本将打印出来的值，你可以使用标准的bash来的这个输出存储在一个变量：

WALLTIME=$(qstat -f $PBS_JOBID | sed -rn 's/.*Resource_List.walltime = (.*)/\1/p') 

您也可以使用它来获取PBS_ *环境变量中不可用的其他信息，例如为作业分配的内存量以及其他可能的东西。