我正在研究一个大的fasta文件，我想根据基因ID拆分为多个文件。我试图从biopython教程使用上面的脚本： def batch_iterator(iterator, batch_size):
"""Returns lists of length batch_size.
This can be used on any iterator, for example to ba
我正在使用Python 2.6.6，并且我试图删除中的，它们与file1中的读取重叠（即相同）。这里是代码我想实现： ref_reads = SeqIO.index("file1.fastq", "fastq")
spk_reads = SeqIO.index("file2.fastq", "fastq")
for spk in spk_reads:
if spk in ref_r
我有以下格式的小FASTA文件： >gene_1 + other data
seq 1
>gene_1 + other data
seq2
>gene_1 + other data
seq3
我想删除的文件的第一个元素。这是一个庞大的Python脚本的一部分，一旦我已经使用该seq，并提取了它的有趣部分，我想从文件中删除它。最终，文件将被清空，因此我可以从文件夹中删除它。 因为我一直
我使用Biopython和Python 3.x从PubMed数据库进行搜索。我正确地获得搜索结果，但接下来我需要提取搜索结果的所有日记名称（全名，而不仅仅是缩写）。目前我使用下面的代码： from Bio import Entrez
from Bio import Medline
Entrez.email = "[email protected]"
handle = Entrez.esea
我要生成硒代半胱氨酸的标志，但是当我选择的选项与reduced_protein_alphabet我得到错误“但却难免重复字母” weblogo -f sc.txt -D fasta -o sc_logo -F pdf -a reduced_protein_alphabet -s large -n 100 -c chemistry