fasta

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    我很想知道是否有任何生物信息学工具可以处理multiFASTA文件,这些文件可以为我提供诸如序列号,长度,核苷酸/氨基酸含量等信息,也可以自动绘制描述性图表。 R生物传感器解决方案或BioPerl模块也可以,但我找不到任何东西。 你能帮我吗?非常感谢:-)

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    我有一个FASTA文件包含几个蛋白质序列。格式就像 ---------------------- >protein1 MYRALRLLARSRPLVRAPAAALASAPGLGGAAVPSFWPPNAAR MASQNSFRIEYDTFGELKVPNDKYYGAQTVRSTMNFKIGGVTE RMPTPVIKAFGILKRAAAEVNQDYGLDPKIANAIMKAADEVAE GKLN

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    我有兴趣从FASTTA格式的BLAST输出中获取未去除的序列。我以为我可以使用hsps_no_gap但它不起作用。有什么方法可以用来完成这个任务吗?

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    我有一个fasta文件(第一个序列在下面提到)与长描述。我需要选择特定的描述字段。当我使用下面的代码时;整个描述进入字符串。 from Bio import SeqIO for record in SeqIO.parse("geneTemp.fasta", "fasta") : id=record.id desc=record.description print des

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    我需要解析初步GenBank平面文件。该序列尚未发布,因此我无法通过加入来查找并下载FASTA文件。我是生物信息学的新手,所以有人可以告诉我在哪里可以找到BioPerl或BioPython脚本来自己做这件事?谢谢!

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    以下是我搜索用户提供的主题在命令行输入的FASTA文件的代码。当我运行它并输入一个我知道在文件中的图案时,它会返回'Motif not found'。我只是一个Perl的初学者,我无法理解如何让它打印出主题,更不用说返回标题了。我希望有任何帮助解决这个问题。 谢谢。 use warnings; use strict; my $motif; my $filename; my @seq;

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    我有fasta格式的序列,其中包含序列开始处的17 bp引物。引物有时会有不匹配。因此,我想删除序列的前17个字符,除了来自fasta头文件。 的序列是这样的: > name_name_number_etc SEQUENCEFOLLOWSHERE > name_number_etc SEQUENCEFOLLOWSHERE > name_name_number_etc SEQUENCEFO