igraph

0热度

1回答

我有类似于这两个邻接矩阵数据： data1999 <- data.frame(node1=c("A", "A", "B", "D", "B", "C", "D"), node2=c("A", "A", "D", "B", "B", "C", "D"), link=c(1, 1, 1, 1, 1, 1, 1), stringsAsFactors

1热度

1回答

创建具有不同平均等级但具有相同传递性的图

我期待创建一系列具有固定节点数（例如n = 100）的图，具有不同的平均度但网络中具有（几乎）相同的传递性。此刻，我可以拿出最好的是 require(igraph) g1 <- sample_pa(n = 100, power = 0.5, m = 2) # degree 3.94, transitivity 0.075 g2 <- sample_pa(n = 100, power = 0

0热度

1回答

为二部图的一种模式的顶点设置矢量属性

我有一个二部图和一个数据框，每行与图的第一边的每个顶点相关联。该图并未连接，当我找到图的最大组成部分时，我必须对数据框进行子集化（这不会给我正确的答案）。另一种可能的选择是将数据框的行设置为图的第一边的顶点的属性（我不知道该怎么做）！这里是一个玩具例子： edgelist = matrix(c("A","a","A","b","B","b","C","c","D","c"),ncol=2,byro

2热度

1回答

如何使用R中的附加信息创建邻接列表中的igraph对象？

我在形式 df <- data.frame(name= c("Sue", "Rob", "Jacob", "Terry"), f1 = c("Rob", "Sue", "Rob", "Jacob"), f2 = c(NA, "Terry", "Terry", NA), f3 = c(NA, "Jacob", NA, NA), bf1

0热度

1回答

如何将一个图中的边添加到R中的另一个图中？

我正在使用R（v3.4.1）。我有一个graphml文件的图形： g <-read.graph(file = "./proteinLC.graphml",format = "graphml") 我需要从图G节点的10％，并把它们绘制米我试图做这样的事情： m <- add_edges(g, c(sample(1:length(E(g)), length(E(g))*0.1, replace

0热度

1回答

为什么我不能基于igraph公式中的as.matrix命令创建矩阵？

我想创建一个基于igraph公式的矩阵（11行和2列）。它不工作 bin_node_size<-vcount(g) #network size (number of nodes) wei_node_str<-graph.strength(g) #node strenght of each vertex bin_node_deg<-degree(g) #node degree for each

0热度

1回答

R igraph布局没有执行，因为他们应该

我运行一些使用igraph的小图，我无法复制一些漂亮的标准布局函数。我的边缘是不同的长度和重叠，只是凌乱。我一直在努力寻找1.5左右，没有任何进展。下面的这个例子给了我这张图。 library(igraph) set.seed(123) x <- sample(LETTERS[1:4], 100, replace=TRUE) y <- sample(LETTERS, 100,

0热度

1回答

networkX相当于IGRAPH vertexClustering

Python的IGRAPH具有的功能集群（），它允许你把一个图形变成vertexClustering通过 igraph.Graph().clusters(mode ='STRONG') 这让我拿一个图表，并拿出所有节点的列表连接在一起。我的问题是，networkX是否具有相同的功能？

4热度

1回答

的R - “最大子图” 图中

欲识别的最大子图在给定的图表例如，对于这些曲线图：和此代码： library("igraph") from <- c(1,2,3,3,6,6,8,9) to <- c(2,3,4,5,7,8,6,10) edges = data.frame(from,to) g<- graph_from_data_frame(edges,directed=FALSE

2热度

1回答

合并Igraph时维护属性名称

问题我有两个单独的网络，没有重叠的节点或边，它们都具有相同的属性。我想将这两个网络组合成一个网络，然后由两个不同的组件组成。但是，当我尝试使用union命令合并它们时，属性从“属性”重命名为“attribute_1”和“attribute_2”。这会发生在命令帮助文件中，但我找不到合并这两个网络的明显方法。的情况在下面的代码块 library(igraph) #create a 4 no