2013-08-16 57 views
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我创建了一个热图,并使用树状集群得到以下​​结果颜色:热图聚类/聚类值/

enter image description here

亮点,你在该行看到树状图基本上是什么我米看区分。我需要一种方法来获取这些特定行的值,或者找到一种方法来获取与这些行关联的所有行名称。或者,是否可以为每一行设置一个特定的颜色。我不知道任何方法。

原因是我正在创建与热图相关的散点图。实质上,每个行(未包含在热图中的名称)将是散点图上的一个点,并且每个突出显示的树状图簇将在散点图上被分配一种颜色。因此,属于与每个群集关联的行的散点图上将有6种颜色。

一些例子为别人在做什么如下:

Instead of colouring the dendrograms, this adds a bar 相反着色树形图的基础上增加了酒吧

enter image description here 这增加了色彩的树状本身

目前,我正在制作热图如下:

hm <- heatmap.2(percentMatrix, scale="none", 
cexRow=0.75, cexCol=1.0, key=TRUE, keysize=1.5, 
margins=c(10,22), 
trace="none") 

我很感激一些帮助。

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因此,似乎经过多少修补,我设法弄明白了。我可以简单地打印hm来获取地毯,然后解析出订单。我已经使用cutree为热图添加了一个rowcolorbar。