igraph

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创建的igraph我有一个类似的问题这一个：Reading adjacency lists with isolated nodes using igraph 我想绘制节点，其中一些没有关系。但由于某些原因在上面的线程中提到的解决方案是行不通的我的数据 data <- data.frame(ID = c(143918,176206,210749,219170,247818,314764,32145

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如何将igraph拆分为选择连接的子图？

这是问题的一个扩展以前发布的： How to split an igraph into connected subgraphs? 我会用同样的例子作为对前一个问题 library(igraph) g <- simplify( graph.compose( graph.ring(10), graph.star(5, mode = "undirected") ) ) +

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如何在igraph中提取子图

我想提取该节点周围的子图。 library(visNetwork) library(igraph) library(dplyr) g<-data.frame(a=c(LETTERS[1:5], LETTERS[2:6]),b=c(LETTERS[2:6], LETTERS[7:11])) %>% as.matrix %>% graph.edgelist() visIgrap

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的igraph保存情节不输出文件名作为一个对象

我跟着的igraph的saving plot文档工作，但我通过图列表需要循环，这是行不通的： for (f in flist) { df <- read.table(f, header=TRUE, sep='\t', quote='', comment.char='') png <- paste0(f, '.png') g <- graph_from_data_fra

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使用R查找文本文件中的数据直径

我有一个由20000行和3列Here you can find a sample from the out1.txt file组成的文件。我试图导入到R的线，然后找到每20线的直径（我的意思是将20000线分成1000部分，每部分包含20线），所以首先我需要分别读取每20条线，然后应用直径函数在R. 之后，我需要读取每个部分作为图形，然后找到直径。包含20000行的文件的名称是（out1.txt

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基于边权重的子集图

我有一个图G =（V，E），其中有几个属性，包括边权重属性。我试图根据权重高于x的条件创建子图。我试过了标准R子集选项g <- E(g)[weight > max(weight)*.10]，但我总是得到一个向量。我不知道我在做什么错在这里。

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在Mac OSX中安装python-igraph Sierra

我在我的Mac中安装了anaconda。我正在尝试安装python-igraph。我尝试下面的命令来安装它： $ brew install igraph $ pip install python-igraph 我的蟒蛇设置： Python 2.7.13 |Anaconda custom (x86_64)| (default, Dec 20 2016, 23:05:08) [GCC 4.2

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如何在不使用data.frames的情况下合并两个igraphs对象？

比方说，我有两个图：net1和net2具有相同的节点名称。我想联合net1和net2成一个图形net然后从节点A添加一个新的边缘到节点A其中从部件net1第一节点A和从组件net2第二节点A。我曾尝试： library(igraph) net1 <- graph_from_literal(A-B-C) net2 <- graph_from_literal(A-B-C) par(mfrow=c

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支持igraph中稀疏网络

我正在处理一个稀疏数据网络集，数据集中的顶点ID可以保存一个值，任何地方在1-4000范围内，例如一小部分数据可能包含顶点值 2,300,400,700,3000，...... 对我来说，如果Igraph库只接受稀疏数据集或期望值的范围，我还不清楚？我是否已经重新确定/重新映射我的数据集成连续的数据范围之前我调用任何IGRAPH功能例如重新映射的数据值作为每 2变为1 300变为2 400变成

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查找igraph顶点的第n级邻居

我有一个很大的igraph对象。对于给定顶点的有向图，我有兴趣列出节点距离初始节点的距离小于d。例如，如果我正在从V0开始的3个步骤内查找顶点，函数将返回一个数据框，其中第一列包含与初始顶点的距离，第二列包含顶点的名称。 level, vertex.name 0, V0 1, V23 1, V45 ... 2, V12 ... 3,V730 我尝试使用功能的igraph的nei