igraph

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    如何让igraph停止使用大图形崩溃？

    我正在用一个相当大的igraph网络（大约200,000条边）。我计算版本接近中心（谐波中心性），具体如下： #Create igraph network object: g <- graph.edgelist(as.matrix(d), directed = FALSE) g <- simplify(g) #Normalized harmonic centrality: h <- 1/
    r igraph 2017-02-16

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    使用EdgeList都从二分图

    构造归属网络我有一个表示的二分网络的EdgeList都。 ID1 ID2 1 123 1 124 1 125 2 123 2 126 3 127 3 123 3 130 ID1是一类演员，ID2是另一类演员。如何分配的演员类的属性（在ID1所有顶点为一类，在ID2所有顶点为另一个类）使用它的二分网络分析。另外，我想
    r igraph 2017-02-16

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    平均距离与igraph中的平均距离

    我正在尝试计算我的网络的平均路径长度，并且遇到以下问题。我过去使用igraph包中的average.path.length。这一次，我决定采取不同的路线：我想使用distances功能（也从包igraph），然后找到所有距离的平均值。我的理解是distances函数只是计算图形顶点之间的成对最短路径，因此应该返回平均路径长度。但是，当我尝试使用这种方法时，我注意到我得到了average.path.
    r distance igraph 2017-02-20

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    应用的权重矩阵，以现有的图

    假设我有一个很简单的无向图G与Ñ = 4个节点： G = graph_from_literal(1--2, 1:2--3, 1--4) 和Ñ X Ñ权重矩阵如W： 1 2 3 4 1 0.0 0.5 0.9 1.3 2 0.5 0.0 1.0 0.0 3 0.9 1.0 0.0 0.0 4 1.3 0.0 0.0 0.0 问：什么是施加权重的最快方法到G的边缘？ 我可以使用grap
    r igraph 2017-02-23

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    R中

    我使用的igraph并试图vertices.When我尝试删除顶点77来删除一些，我看到顶点78删除顶点连接到它被删除，而不是77本身...... library(graph) out <- read.csv("~/Downloads/adj/out.adjnoun_adjacency_adjacency", sep="") out.network<-graph.data.frame(ou
    r igraph 2017-02-25

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    如何着色成组节点在图表

    V（S1）[ “158”] $颜色< - “黄金” 上面的代码改变仅一个节点的颜色。我想补充我的选择的多个节点说158,43，87和应用相同的颜色.. 如何添加节点
    r igraph 2017-02-26

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    累积值属性而降序一个的igraph对象

    我已经从数据帧df制成的igraph对象g： df <- data.frame(c(0,1,2,2,4), c(1,2,3,4,5), c(0.01, 0.03, 0.05, 0.01, 0.02)) colnames(df) <- c('parent_id', 'id', 'dt') g <- graph_from_data_frame(df) 边缘被parent_id和id之间进行比较
    r igraph edges cumulative-sum 2017-02-26

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    R中图节点的二阶邻居

    我正在寻找一种有效的方法来查找大图中所有节点的精确度的邻域。即使它存储图形为稀疏矩阵，igraph::ego炸毁： require(Matrix) require(igraph) require(ggplot2) N <- 10^(1:5) runtimes <- function(N) { g <- erdos.renyi.game(N, 1/N) system.t
    r matrix sparse-matrix igraph 2017-02-28

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    绘制定义一些固定节点的网络图，以在地图上绘制图形

    我有一张由德国人和城市（节点）组成的图。我想根据他们的位置将这些城市映射到德国的地图上，并将人员和连接添加到固定城市。因此，我不想为每个人指定位置，因为这非常耗时。 有没有办法在地图上绘制网络图，方法是指定城市的位置，但不适用于与城市连接的人员？据我看，它与igraph，我只能修复所有或没有节点，但不是一些节点。 是否可以使用igraph,map和ggmap？我打开其他附加库来归档我的想法。 附加
    r igraph 2017-03-03

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    有向图中的特征向量

    我想用igraph软件包测量R中有262000个节点和1M个边的有向图的特征向量中心性。当我运行命令我得到这个错误： > ev<-evcent(amazon,directed=TRUE) Error in .Call("R_igraph_eigenvector_centrality", graph, directed, scale, : At arpack.c:1174 : ARPACK er
    r igraph graph-theory directed-graph eigenvector 2017-03-08
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