如何在Matlab中编写以下函数用于MS蛋白质分析？

Question

我需要你的帮助。我有超过40000种fasta文件格式的蛋白质。

首先，我想编写一个函数：

• 即能计算出B超的创建从靶蛋白（MAT文件）的肽数据库群众和y离子
• ，创建一个数据库肽从诱饵蛋白来（MAT文件）

然后，我想：

• 负载所观察到的数据
• 滤波器候选肽肽数据库给予一定ppm的精度
• 编写一个函数，分数针对所观察到的数据的候选肽
• 拿出一个阈值方案来辨别bonafide肽从假冒的

Answer 1

要开始使用频谱的比赛，FASTA是文本文件格式。要编写文本文件，请检查MATLAB文档fopen,fprintf和fclose。要从您编写的数据文件加载文本，您可以使用fopen，fscanf和fclose。实际上，MATLAB也有fastainfo,fastaread和fastawrite。您应该检查这些命令的MATLAB文档以及其他可能对您有用的FASTA相关和蛋白质分析相关命令（我还没有做过蛋白质分析，因此我不能说哪一个是您需要的）。

而且，你问这么多东西在一个问题，它是不可能回答所有的问题，因为你的问题恕我直言，是一种“我怎样写我的整个节目？”。但我认为你可以开始使用我列出的命令，并且当你编写了一些代码和你想要解决的问题时，你可以发布一个关于它的新问题，部分代码。

Answer 2

MATLAB的生物信息工具箱包含积木程序，你可以放在一起，以实现这一目标。如果您在将它们放在一起时遇到特定问题，请发布具体问题。