2011-05-17 43 views
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Biopython noob在这里,我试图创建一个程序,使用Biopython包字母和字母模块IUPAC写出名为alphabetSoupOutput.txt的文件列出的类的字母。BioPython字母汤

  1. ThreeLetterProtein
  2. IUPACProtein
  3. unambiguous_dna
  4. ambiguous_dna
  5. ExtendedIUPACProtein
  6. ExtendedIUPACDNA

字母每组应该在输出文件和被写入到它的单一线信件应由com分隔马斯。每组字母之前的行应该包含一个描述这些字母的标签,并且在该行的第一个位置上有一个#号。

三个字母蛋白

丙氨酸,ASX,半胱氨酸,...,采集Glx

蛋白快报 A,C,d,E,...,Y

我该怎么办这个?

+0

我不知道如何提取从classobj字母。有任何想法吗? – Francis 2011-05-17 18:32:08

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